BSA相关知识——质量、数量性状和作图群体 | BSA专题

近期小编将集中为大家讲解BSA（Bulked Segregant Analysis，集团分离分析法）相关知识，包括BSA简介，分子标记技术，质量、数量性状和作图群体，基因、QTL定位，BSA性状定位研究思路及常见问题及解答等，每天5分钟，轻松学习BSA相关知识~

话不多说，进入今天的专题——质量、数量性状和作图群体介绍。

1质量性状和数量性状

生物的目标性状大致可分为质量性状和数量性状两种。所谓质量性状指的是该性状可以被定性，在群体中可以被明确的分组，组间差异显著，比如花色等，质量性状一般受单基因或少数几个基因位点控制，一般表现为显隐性特点，不易受环境的影响，表现稳定。数量性状指的是某一性状在群体中变异呈连续性分布，无法明确分组，比如株高等，这类性状无法通过表型来推断其基因型，易受环境影响和遗传背景影响。需要注意的是，质量性状和数量性状的划分完全依赖于目标性状研究群体的分离情况，因此，相同的性状既可能是质量性状，也可能是数量性状。

2作图群体

作图群体是指双亲通过杂交和自交形成的后代，后代中性状和标记位点基因型均是分离的，也叫做分离群体，因为这种群体常用于遗传图谱构建，因此叫做作图群体。BSA性状定位的核心原理是检测双亲的SNP并计算子代池间全基因组水平的SNP-index，由于与性状连锁的标记会在两个池间表现出多态性，而与目标基因距离较远或不连锁的标记会在两个池间表现出随机的杂合型（因为染色体自由组合和重组）。这种方法可较快的得到与性状连锁的分子标记。因此，必须使用分离群体中的单株进行混池。

BSA所用的作图群体一般为F2或RIL，F2群体是由两个不同基因型的纯合双亲杂交产生F1代，F1再自交而形成的群体。其优点是建立F2群体较容易，适用于一些自花授粉植物（水稻）和异花授粉植物（玉米）；存在杂合基因型：对于显性标记，将无法识别显性纯合基因型和杂合基因型，降低作图的精度。缺点是不易长期保存，有性繁殖一代后，F2群体的遗传结构就会发生变化。

图1 F2群体构建流程

RIL群体即重组自交系群体（Recombinant Inbred lines）。RIL是利用F2群体中的单株进行连续自交直到F6~F8代，每个F2单株形成一个家系，这些家系即组成了重组自交系群体。

RIL群体的优点是重组程度高。由于RILs在家系变成纯合前经历了多次减数分裂，重组程度高于F2群体，因此RIL群体构建的图谱比F2群体有着更高的解析度；可长期反复试验：用于构建分子标记连锁图、QTL定位研究等。缺点是构建RIL群体要经过田间几代的选择和鉴定，费时费力。如果仅是为了定位质量性状基因的话，选用RIL群体是不明智的；另外，异花授粉植物由于存在自交衰退和不结实现象，建立RIL群体也比较困难。

图2 RIL群体构建过程

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